Восстание началось из-за законов, введенных византийским императором Юстинианом I (527-65) против самаритян.
Поводом к нему послужил учиненный христианами погром самаритян в Бейт-Шеане.
Узнавшие о разгроме еврейского государства Химьяр, в Скифополе самаритяне напали на христиан и спалили часть города.
В мае 529 г. вооруженные самаритяне ворвались в Шхем и истребили местных христиан, в том числе сменивших веру отступников.
Византийский император Юстиниан обвинил в попустительстве архонта Васса и казнил его.
Весной 529 г. восставшие евреи и манихеи, под руководством Юлиана начали сжигать церкви, резать на куски священников (после чего сжигали их вместе с мощами), в том числе епископа Саммона, и знать.
Юлиан разрушил все церкви в захваченных городах. Он сделал своей столицей Шхем.
Устроив в Неаполе Сирийском в честь победы конские ристалища, Юлиан отрубил голову победителю Никию, когда узнал, что тот христианин.
Юстиниан обратился за помощью к Гассанидам, и в 531 г. византийцы и арабы во главе с шейхом Абу-Карибом подавили восстание, убив 20 тыс. человек и столько же поработив.
Юлиан отступил из Шхема в самарийские горы, но погиб в бою. По словам Феофана Исповедника, Юлиану отрубили голову.